Estonská fotbalová reprezentace do 21 let (estonsky Eesti U-21 jalgpallikoondis) je estonská mládežnická fotbalová reprezentace složená z hráčů do 21 let, která spadá pod Estonskou fotbalovou asociaci (EJL – Eesti Jalgpalli Liit). Reprezentuje Estonsko v kvalifikačních cyklech na Mistrovství Evropy hráčů do 21 let a v případě postupu i na těchto šampionátech.
Fotbalisté musí být mladší 21. roku na začátku kvalifikace, to znamená, že na evropském šampionátu poté mohou startovat i poněkud starší.

Estonská reprezentace do 21 let byla založena po získání nezávislosti země na SSSR. První zápas odehrála v roce 1994 proti Chorvatsku. Poprvé zasáhla do kvalifikace na Mistrovství Evropy U21 1996. Ve své historii se zatím neprobojovala na závěrečný turnaj Mistrovství Evropy hráčů do 21 let.

Estonsko U21 je estonský fotbalový tým do 21 let, který reprezentuje Estonsko na mezinárodních turnajích. Tým je řízen Estonským fotbalovým svazem. Estonsko U21 se kvalifikovalo na Mistrovství Evropy ve fotbale hráčů do 21 let pouze jednou, a to v roce 2009. Tým skončil v základní skupině, když prohrál všechny tři zápasy.